En mand med Wolverines superkræfter der føler sig fortabt, og har mistet gejsten til livet, er en farlig cocktail…
Instruktøren James Mangold og Hugh Jackman giver et indblik i historien og karaktererne i filmen, og forklarer referencerne til den japanske ronin, som betyder en herrerløs samurai.
Filmen forgår efter X-MEN filmen ‘The Last Stand’, hvor Wolverine føler sig fortabt pga. Jean Greys død, som han jo selv forårsagede. Derfor holder Logan/Wolverine for sig selv, og man har aldrig før oplevet karakteren så enspænderagtig som i den her film. Logan/Wolverine er træt af livet, og har simpelthen mistet gejsten, eftersom han ikke føler nogen form for formål mere. Derfor accepterer Wolverine også et tilbud fra hans gamle ven Yashida (Hal Yamanouchi), der ophører Wolverines healing kræfter, og dermed gør Wolverine dødelig.